Misirin tarixi dövrü Məsihin doğulmasından əvvəl üçüncü və dördüncü minilliklərin əvvəlində başlamışdır. İşğalçıların və daxili sarsıntıların təsirinə məruz qalan qədim mədəni ənənə eramızın IV əsrində xristianlığın qəbuluna qədər davam etdi. Təxminən üç min yarım il ərzində Misir tanrılarının siyahısı və funksiyaları əhəmiyyətli dəyişikliklərə məruz qalmışdır. Misir tanrıları öz qonşularına - assuriyalılara, hetlərə, hiksoslara, ellinlərə xas olan xüsusiyyətlər və adlar əldə etmişlər.
Misirin vahid hökmdarın hakimiyyəti altında birləşməsindən sonra ölkənin ayrı-ayrı bölgələrinin və tayfalarının bir çox tanrıları ümumi panteona daxil oldular, lakin onların əksəriyyətinə yalnız öz kultunun yarandığı mühitdə hörmət edildi. Bəzi tanrılar tədricən ümumi Misir mənasını qazandılar. Bir pişik başı olan ilahə Bastet, şübhəsiz ki, siçanlardan taxıl ehtiyatlarının keşikçiləri kimi pişiklərə pərəstiş kultundan böyüdü. Misirdə kənd təsərrüfatı böyük rol oynamışdırrolu, məsələn, Hellasdan fərqli olaraq, əsasən ticarət və hərbi fəthlər hesabına yüksəlmişdir. Antropomorfik Misir tanrılarına tez-tez bu və ya digər kultun yarandığı ehtiram əsasında heyvanın başı verilirdi. Məsələn, Thoth tanrısının ibisin başı, tanrıça Sokhmetin (Sekhmet) şirin, Anubisin itin başı var idi.
Ölkənin müəyyən əraziləri yüksəldikcə, sülalələrin dəyişməsi və ya paytaxtın yeni yerə “köçməsi” baş verdi, “birinci eşelon”un Misir tanrıları da dəyişdi. Qədim Misir dininin maraqlı xüsusiyyəti çoxlu sayda kosmoqonik miflərin (yəni dünyanın mənşəyi ilə bağlı versiyaların) olması idi və hər bir məhəllədə bu çətin məsələdə əsas rolu yerli tanrı oynayırdı.
Bu qədər çoxluqda yerli separatizmin əsasına çevrilən Misir tanrıları, heç şübhəsiz, tək bir ölkəyə lazım deyildi. Bundan əlavə, çoxsaylı kultlar ölkənin daxili nizamlanmasına, ordunun saxlanmasına və s. daha böyük fayda ilə xərclənə bilən külli miqdarda maddi vəsaitin xərclənməsini tələb edirdi. Böyük sərvətə və nüfuza malik olan kahin qəbilələri birbaşa fironun yeganə hakimiyyətini təhdid edirdilər.
Hər şeyi nəzərə alsaq, Firon IV Amenhotep, Akhenaton adını alaraq, ümumi Misir dini kimi kiçik regional tanrı Aton (ilahiləşdirilmiş günəş diski) kultunu təqdim edir. Ancaq ənənənin ətaləti çox güclü idi və Akhenaten qırx yaşına çatmadan vəfat edir. Ən inandırıcı versiyaya görə, o idizəhərləndi. Düzdür, təqiblər ailəyə toxunmadı və həyat yoldaşı (məşhur Nefertiti) ərinin ölümündən uzun illər sonra sağ qaldı.
Ölkənin farslar və daha sonra Yunanlar tərəfindən ələ keçirilməsindən sonra Misir tanrıları və ilahələri tədricən əvvəlki təsirlərini itirməyə başlayır, tənəzzülə doğru gedir. Onlar işğalçıların tanrıları ilə birləşirlər. Məsələn, Makedoniyalı İskəndər Misirdə sinkretik Misir-Yellinizm tanrısı Zevs-Amonun oğlu kimi hörmətlə qarşılanırdı.
Adları həm yerli, həm də qarışıq mənşəli olan Misir tanrıları öz yerlərini yeni bir dinə - Xristianlığa verməyə başlayanda, tədricən qədim Misir yazısının unudulması başlandı. İmperator Konstantinin dövründə Misir dini ənənəsinin sonuncu daşıyıcısı öldü, bundan sonra uzun əsrlər boyu qədim Misir tanrılarının adları yalnız Yunan və Roma tarixçilərinin yazılarından məlum idi. Lakin onların hər ikisi Misir mədəniyyəti ilə artıq zəiflədiyi bir vaxtda tanış olublar və çətin ki, kahinlər öz dinlərinin sirlərinə yad insanlara (çox vaxt aqressiv olanlara) təşəbbüs göstərsinlər.
Qədim heroqlifləri deşifrə etmək cəhdləri həm ərəb alimləri, həm də avropalılar tərəfindən dəfələrlə edilib, lakin nəticəsi olmayıb. Və yalnız on doqquzuncu əsrin əvvəllərində parlaq dilçi Fransua Şampolyon Misir mətnlərini deşifrə etmək üçün açar tapa bildi. Həmin andan Qədim Misirin tarixi və mədəniyyətinin öyrənilməsinin müasir dövrü başladı.